Ce repository contient les protocoles de séquencage utilisés par le laboratoire, et sont accessibles à tous.
Vous trouverez également ici toutes les ressources associées aux WEBINAR organisés par le CNR.
1/ Partie Wetlab : protocoles de séquencage:
lien diaporama: lien Gdrive de partage
lien vidéo: Non disponible. Désolé:(
2/ Partie Drylab : traitement des données post-séquençage:
lien diaporama:
lien vidéo:lien Gdrive de partage
3/ Partie Validation : Analyse et interpretation des séquences:
lien diaporama:
lien vidéo: lien Gdrive de partage
Lien dataset ONT: ARTIC-ONT
Note: Les fichiers sont archivés.
Le dataset contient:
-une partie des fast5 du run.
-les fastq basecallés.
-le rapport de séquencage.
A décompresser avec la commande:
tar -xvf archive
Lien dataqet Illumina: ARTIC-ILLUMINA
L'ensemble des fastq sont archivés, et à décompresser avec la commande:
tar -xvf archive
Pour ce qui concerne l'aspect bio-informatique, n'hésitez pas à me contacter au mail suivant : hadrien.regue@univ-lyon1.fr